。关税不稳定是影响中小企业跨境电子商务发展的最大政策障碍。目前，许多国家都在调整跨境电商政策，这给企业把握关税问题带来了困难。第二个是。在国际化经营中，中小企业必须意识到其产品、服务、交易对手、供应链等方面可能涉及的不合规问题。目前，通关仍是跨境电商交易的最大障碍。最后。跨境电子商务严重依赖网上支付，而网上支付是一个信用支持系统。对于线上订货和线下配送，由于不同国家的产品质量标准不统一，卖家对商品质量的承诺并不总是被买家的交易结果所认可。此外，第三方结算机构对交易资金的保护力度较大。各国在法律和监管体系建设上的差异，都凸显了跨境电子商务交易中的信用问题。
跨境电子商务的同质化严重削弱了中小企业的市场竞争力。目前，国际市场的需求已经个性化，品牌建设是满足这一需求的重要支撑点。随着跨境产业发展的深入，低水平的同质化竞争难以持续，品牌化以其自主性和溢价能力成为跨境电商发展的主导方向。在日益激烈的市场竞争中，如何吸引和满足消费者的个性化需求成为各大平台竞争的焦点。一流的品牌形象、极致的用户体验和多变的营销策略尤为重要。未来，跨境电商线上线下融合将不断深化，平台将更加注重用户体验。为了增强用户粘性，跨境电商将从分销型向自有品牌型转变。但是，中小企业的品牌意识普遍不强，很多产品的市场定位不明确。无论是从功能、工艺、品质、外观设计、卖点提炼等多维度定义，都无法进行差异化经营。企业往往为了短期利益而固化贴标模式，导致大量劣质假冒产品流入电子商务市场。
从制造商到消费者，都需要高效的物流和外汇结算服务，但跨境物流存在运费、关税、安全等问题。中小企业跨境电商主要以小批量、多批次外贸订单为主，需求多依赖空运，直接导致物流成本增加。如果要建立一个强大的物流基础，巨大的资金投入让中小企业犹豫不决。然而，物流配送时间长，加上海外追踪困难，往往导致包裹丢失和损坏，严重影响了客户的购物体验。
管理水平低。跨境电子商务的发展需要一个高效的管理机制，但大多数中小企业管理粗放，特别是在人才支持方面。85.1%的企业愿意以高薪聘请专业人才，但只有52.3%的企业在预期薪酬范围内成功招聘到自己想要的人才。随着跨境电商进入纵向深化发展阶段，跨境电商人才短缺问题将更加突出。一方面，具有基本技能的人才数量仍然不足。另一方面，高端人才更难找到，数量与质量相结合的问题成为制约跨境电商发展的基本问题。
